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Un equipo de investigación internacional publica el pangenoma de cebada

Con la secuenciación completa del genoma de 20 genotipos diversos, los investigadores completaron el primer paso para decodificar la información genética de toda la especie: el pangenoma de la cebada.

Fundación Antama / 11 de febrero, 2021.- Un equipo internacional dirigido por científicos del Leibniz Institute for Plant Genetics and Cultured Plant Research (IPK) en Alemania, junto con colegas del Instituto James Hutton y la Universidad de Dundee en Reino Unido, ha desentrañado la diversidad genética de la cebada domesticada. Con la secuenciación completa del genoma de 20 genotipos diversos, los investigadores completaron el primer paso para decodificar la información genética de toda la especie: el pangenoma de la cebada.

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El equipo de investigación utilizó datos de diversidad genética de toda la especie para identificar y seleccionar 20 genotipos muy diversos para la secuenciación completa de alrededor de 22.000 muestras de semillas de cebada del banco de genes en el IPK. “Los criterios para la selección incluyeron las mayores diferencias posibles en su diversidad genética, origen geográfico y rasgos biológicos, como el tipo de invierno o primavera, cáscara de grano o tipo de hilera“, explica Nils Stein, jefe de Genómica de Recursos Genéticos en el IPK, institución líder del estudio.

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Los científicos encontraron dos diferencias importantes en el orden lineal de la información genética en los cromosomas que se denominan variantes estructurales. En el primero, se estableció un vínculo con el “mejoramiento por mutación” en la década de 1960 y desde entonces se ha extendido desapercibido a través del mejoramiento hasta las variedades actuales. En el segundo, la variación observada posiblemente ocurrió y se seleccionó durante la adaptación ambiental a medida que la producción de cebada se extendía desde sus orígenes en el Creciente Fértil.

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“Esta nueva observación confirma que las principales variantes estructurales pueden desempeñar un papel decisivo tanto en la evolución como en el mejoramiento de los cultivos. La única forma en que se podrían haber descubierto es a través de la secuenciación completa del genoma de diversos individuos”, explica Robbie Waugh, del James Hutton Institute y la Universidad de Dundee. Más información en el artículo del Instituto James Hutton y en una entrevista con Nils Stein en IPK News.

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