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Descifran el genoma de la nuez: facilitará el desarrollo de mejores variedades

Una nueva investigación realizada en la Universidad de California (Davis) podría proporcionar un gran impulso a la industria de nogales al facilitar el desarrollo de nogales mejor equipados para combatir plagas y problemáticos patógenos transmitidos por el suelo.

En un nuevo estudio, un equipo de científicos de la Universidad de California, Davis y el Servicio de Investigación Agrícola (ARS) del USDA de Estados Unidos, utilizaron un enfoque único para secuenciar los genomas de la nuez inglesa y su pariente silvestre de América del Norte aprovechando las capacidades de dos tecnologías de vanguardia: la secuenciación de ADN de larga lectura y el mapeo del genoma óptico. Se cree que las secuencias de genoma resultantes son de la más alta calidad jamás ensamblada de cualquier cultivo perenne amaderado.

“Al secuenciar el genoma de un híbrido de nogal, producimos secuencias genómicas completas para ambos padres en el tiempo que normalmente se requiere para producir la secuencia de un genoma”, dijo Ming-Cheng Luo, investigador líder en genómica del proyecto e investigador genetista en el Departamento de Ciencias de las Plantas de la UC Davis.

Este enfoque podría aplicarse a la secuenciación del genoma de los árboles y muchas otras plantas perennes leñosas, abriendo las puertas a una mejor comprensión de los mapas genéticos de almendras, pacanas, pistachos y uvas.

“Al igual que el nogal, estos otros cultivos son naturalmente polinizados de manera cruzada y, por lo tanto, son altamente variables”, dijo Jan Dvorak, investigador co-principal y profesor de genética en el Departamento de Ciencias de las Plantas de la UC Davis. “La variabilidad siempre ha complicado en gran medida nuestra capacidad de producir una secuencia de genoma de alta calidad para tales cultivos, pero estas nuevas tecnologías ahora lo hacen posible”, agregó Dvorak.

En California, las nueces se cultivan comercialmente utilizando portainjertos elegidos específicamente por su capacidad para tolerar diversas enfermedades transmitidas por el suelo.

“Elegimos cruzar la nuez inglesa ampliamente utilizada, específicamente con la nuez silvestre negra de Texas debido a su resistencia nativa a varias enfermedades transmitidas por el suelo y nematodos de la raíz, que son plagas graves de la nuez en California” dijo Dan Kluepfel, científico del USDA-ARS e investigador principal del proyecto de desarrollo del portainjerto de nuez.

Las secuencias de genoma ensambladas de las dos especies de nogales ahora también ayudarán a los investigadores a identificar los marcadores genéticos que los mejoradores pueden usar para desarrollar nuevas variedades con resistencia mejorada a patógenos y plagas.

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