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Consorcio que secuenció el genoma del trigo libera información a la comunidad científica

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Después del anuncio en enero 2016 sobre la obtención de un conjunto de todo el genoma del trigo harinero, el Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma del Trigo (IWGSC, según sus siglas en inglés), tras de haber completado el control de calidad, liberó este revolucionario recurso dejándolo disponible para los investigadores a través del repositorio de secuencia del trigo de IWGSC en URGI- INRA, Versalles, Francia.

Los mejoradores de trigo y científicos de todo el mundo podrán descargar y utilizar este nuevo e invaluable recurso para acelerar los programas de mejoramiento de cultivos y la investigación genómica del trigo. El conjunto de datos facilitará la identificación de genes asociados con rasgos agrícolas importantes, tales como el aumento del rendimiento, la respuesta al estrés, y la resistencia a enfermedades y, en última instancia, hará posible la producción de variedades mejoradas de trigo para los agricultores.

Desde el anuncio de enero, el equipo del proyecto IWGSC ha estado ajustando los datos para que el genoma ensamblado y liberado a la comunidad científica sea de la más alta calidad posible. El recurso recientemente publicado (sobre la base de datos de secuenciación de Illumina ensamblados con el software de NRGene’s DeNovoMAGICTM) representa con precisión más del 90% del altamente complejo genoma del trigo harinero, contiene más del 97 % de los genes conocidos, y asigna los datos de los 21 cromosomas del trigo.

Esta versión de datos liberados representa el esfuerzo continuado del proyecto IWGSC para producir una “secuencia estándar de oro”: el mapa completo de todo el genoma que posicione con precisión todos los genes y otras estructuras genómicas a lo largo de los 21 cromosomas del trigo. El genoma del trigo es grande (cinco veces mayor el genoma humano) y complejo, con tres grupos de siete cromosomas.

“La política del IWGSC siempre ha sido hacer todos los datos disponibles al público tan pronto como hayan pasado los controles de calidad”, explicó Kellye Eversole, Director Ejecutivo del IWGSC. “De esta manera, la comunidad científica puede empezar a aprovechar los datos ahora, mientras que el Consorcio avanza hacia una secuencia estándar de oro, prevista para ser lanzado en el año 2017.”

Como es habitual en la comunidad científica, la base de datos se puso a disposición para el mejoramiento y la investigación bajo la “Declaración de Toronto“, que resume las reglas para el intercambio de datos antes de su publicación, en virtud del cual el IWGSC se reserva el derecho a publicar los primeros análisis de los datos, lo que incluye descripciones de los cromosomas o análisis a nivel de genoma de los genes, familias de genes, elementos repetitivos, y comparaciones con otros organismos. La información detallada sobre cómo acceder a los datos está disponible en el sitio web de IWGSC.

Durante los próximos meses, el equipo del proyecto IWGSC continuará su trabajo hacia la realización secuencia ordenada y de alta calidad del genoma del trigo, que incluye anotar e identificar la ubicación exacta de los genes, elementos reguladores y marcadores a lo largo de los cromosomas, proporcionando de esta manera herramientas muy valiosas para los mejoradores de trigo. El resultado final integrará todos los recursos genómicos producidos bajo el proyecto IWGSC durante la última década, incluyendo mapas físicos y genéticos individuales.

El trigo es el alimento básico de más de un tercio de la población mundial y representa el 20% del total de calorías consumidas en el mundo. A medida que la población mundial crece, también lo hace su dependencia de trigo. Para satisfacer las demandas futuras de una población mundial proyectada en 9,6 mil millones para el año 2050, la productividad del trigo necesita aumentar en un 1,6% cada año. Con el fin de preservar la biodiversidad, el agua y las fuentes de nutrientes, la mayor parte de este incremento se debe lograr a través de la mejora de los cultivos y sus rasgos en las tierras ya cultivadas en lugar de incrementar nuevas tierras para siembra. En cuanto a otros cultivos importantes, una secuencia de referencia bien anotada del genoma será un recurso muy valioso para alcanzar este objetivo, proporcionando los mapas detallados de los genes y  las redes de genes que se pueden mejorar a través de fitomejoramiento.

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